NCBI blast 数据库本地安装

分类: www365betcom手机版 时间: 2025-08-02 02:25:14 作者: admin 阅读: 6549 点赞: 41
NCBI blast 数据库本地安装

blast软件安装

从NCBI下载安装包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/。下载2.16.0 linux版本,下载并解压,解压之后BLAST就安装好了。用户需要设置环境变量,目的是为了告诉系统在哪里可以找到安装好的BLAST软件。

wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz

wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz.md5

md5sum -c ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz.md5

tar -zxvf ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz

#加入到环境变量

export PATH=$PATH:$PWD/ncbi-blast-2.16.0+/bin

nt/nr fasta下载

从NCBI(Index of /blast/db/FASTA)下载nt、nr fasta文件。

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